氣源是氣相色譜儀載氣和輔助氣的來源。氣相色譜儀的氣路體系，是一個載氣接連運轉、管路密閉的體系。氣路體系的氣密性，載氣流速的穩定性，以及流量的準確性都對色譜試驗成果有影響，GC一般使用的載氣有氫氣、氮氣、氦氣、氬氣和助燃空氣等。

選擇載氣首先要滿足氣相色譜儀檢測器的要求，在滿意分析需求的條件下，盡能夠選用純度較高的氣體。這樣不光會保證儀器的高靈敏度，并且會延伸色譜柱、色譜儀的壽命。例如從柱效率考慮，要求載氣的擴散系數要小，為得到好的峰型，常用氮氣作載氣。對TCD檢測器來講，為提高靈敏度常用傳導大的氫(氦)氣作載氣，而不使用氮氣或氬氣。從安全和分析周期來講，氦氣要比氫氣好，但我國的氦氣資源較少，價格比較高，因此使用氫氣作載氣比較普遍。對于FID檢測器用氮氣作載氣，既安全又可得到比較好的靈敏度。綜上所述TCD檢測器用氫氣、氦氣比較好，用氮氣、氬氣、空氣時靈敏度比較低，易出現N型或W型峰。FID、FPD檢測器常用氮氣作載氣，在特殊情況下也可用氫氣。ECD檢測器一般用氮氣作載氣。

譜析儀器色譜工程師認為，一般載氣選取原則是：

惰性氣體(分析中不與樣品或固定相發生化學反應)，無腐蝕性、在200-400℃范圍內不分解：氣體擴散系數小，以提高柱效率，價格合理、且能滿足檢測器使用要求。

另外，氣相色譜儀配套氣源的種類和純度，應與所分析的樣品和所要求達到的分析精度進行合理的選擇。